Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL6Q6ICC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTL6Q6ICC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTL6Q6ICC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTL6Q6ICC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL6Q6ICC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTL6Q6ICC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTL6Q6ICC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTL6Q6ICC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTL6Q6ICC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL6Q6ICC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL6Q6ICC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL6Q6ICC9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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