Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRAMD4Q6IC98 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRAMD4Q6IC98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRAMD4Q6IC98 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRAMD4Q6IC98 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRAMD4Q6IC98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRAMD4Q6IC98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRAMD4Q6IC98 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRAMD4Q6IC98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRAMD4Q6IC98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRAMD4Q6IC98 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRAMD4Q6IC98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRAMD4Q6IC98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRAMD4Q6IC98 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRAMD4Q6IC98 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRAMD4Q6IC98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRAMD4Q6IC98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GRAMD4Q6IC98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRAMD4Q6IC98 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRAMD4Q6IC98 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRAMD4Q6IC98 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRAMD4Q6IC98 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRAMD4Q6IC98 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRAMD4Q6IC98 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRAMD4Q6IC98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRAMD4Q6IC98 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms