Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CEP135Q66GS9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CEP135Q66GS9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP135Q66GS9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CEP135Q66GS9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CEP135Q66GS9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CEP135Q66GS9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CEP135Q66GS9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CEP135Q66GS9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CEP135Q66GS9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CEP135Q66GS9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP135Q66GS9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CEP135Q66GS9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CEP135Q66GS9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CEP135Q66GS9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP135Q66GS9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CEP135Q66GS9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CEP135Q66GS9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP135Q66GS9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP135Q66GS9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms