Protein–RNA interactions for Protein: Q64LD2

WDR25, WD repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR25Q64LD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR25Q64LD2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR25Q64LD2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR25Q64LD2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR25Q64LD2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR25Q64LD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR25Q64LD2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR25Q64LD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR25Q64LD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR25Q64LD2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR25Q64LD2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR25Q64LD2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR25Q64LD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR25Q64LD2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms