Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXI9

LIPN, Lipase member N, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPNQ5VXI9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIPNQ5VXI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIPNQ5VXI9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIPNQ5VXI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPNQ5VXI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPNQ5VXI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPNQ5VXI9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIPNQ5VXI9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LIPNQ5VXI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIPNQ5VXI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIPNQ5VXI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPNQ5VXI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIPNQ5VXI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPNQ5VXI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPNQ5VXI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms