Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNDC7Q5VTL7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC7Q5VTL7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC7Q5VTL7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC7Q5VTL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC7Q5VTL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC7Q5VTL7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC7Q5VTL7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC7Q5VTL7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC7Q5VTL7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms