Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LIN9Q5TKA1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LIN9Q5TKA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LIN9Q5TKA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LIN9Q5TKA1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LIN9Q5TKA1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LIN9Q5TKA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LIN9Q5TKA1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LIN9Q5TKA1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LIN9Q5TKA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LIN9Q5TKA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LIN9Q5TKA1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LIN9Q5TKA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LIN9Q5TKA1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LIN9Q5TKA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LIN9Q5TKA1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LIN9Q5TKA1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms