Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC181Q5TID7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC181Q5TID7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC181Q5TID7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC181Q5TID7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC181Q5TID7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC181Q5TID7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC181Q5TID7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC181Q5TID7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC181Q5TID7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC181Q5TID7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC181Q5TID7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC181Q5TID7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms