Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP58Q5T655 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CFAP58Q5T655 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP58Q5T655 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP58Q5T655 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP58Q5T655 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP58Q5T655 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFAP58Q5T655 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP58Q5T655 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP58Q5T655 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP58Q5T655 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms