Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIVEP3Q5T1R4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIVEP3Q5T1R4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HIVEP3Q5T1R4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIVEP3Q5T1R4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIVEP3Q5T1R4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIVEP3Q5T1R4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIVEP3Q5T1R4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIVEP3Q5T1R4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIVEP3Q5T1R4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIVEP3Q5T1R4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIVEP3Q5T1R4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIVEP3Q5T1R4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms