Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC35F1Q5T1Q4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC35F1Q5T1Q4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC35F1Q5T1Q4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC35F1Q5T1Q4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35F1Q5T1Q4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35F1Q5T1Q4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35F1Q5T1Q4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35F1Q5T1Q4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35F1Q5T1Q4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC35F1Q5T1Q4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35F1Q5T1Q4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35F1Q5T1Q4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35F1Q5T1Q4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35F1Q5T1Q4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35F1Q5T1Q4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC35F1Q5T1Q4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35F1Q5T1Q4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms