Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2D4BQ5SQS7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2D4BQ5SQS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D4BQ5SQS7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2D4BQ5SQS7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH2D4BQ5SQS7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2D4BQ5SQS7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH2D4BQ5SQS7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH2D4BQ5SQS7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH2D4BQ5SQS7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SH2D4BQ5SQS7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SH2D4BQ5SQS7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SH2D4BQ5SQS7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH2D4BQ5SQS7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2D4BQ5SQS7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2D4BQ5SQS7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D4BQ5SQS7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4BQ5SQS7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D4BQ5SQS7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2D4BQ5SQS7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH2D4BQ5SQS7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH2D4BQ5SQS7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH2D4BQ5SQS7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms