Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN3Q5JUX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN3Q5JUX0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN3Q5JUX0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN3Q5JUX0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN3Q5JUX0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN3Q5JUX0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIN3Q5JUX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIN3Q5JUX0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIN3Q5JUX0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms