Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RALGPS1Q5JS13 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RALGPS1Q5JS13 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RALGPS1Q5JS13 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RALGPS1Q5JS13 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RALGPS1Q5JS13 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RALGPS1Q5JS13 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RALGPS1Q5JS13 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RALGPS1Q5JS13 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RALGPS1Q5JS13 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RALGPS1Q5JS13 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RALGPS1Q5JS13 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RALGPS1Q5JS13 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RALGPS1Q5JS13 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RALGPS1Q5JS13 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RALGPS1Q5JS13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RALGPS1Q5JS13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RALGPS1Q5JS13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RALGPS1Q5JS13 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RALGPS1Q5JS13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RALGPS1Q5JS13 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms