Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDK2Q58EX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDK2Q58EX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDK2Q58EX2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDK2Q58EX2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SDK2Q58EX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SDK2Q58EX2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SDK2Q58EX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDK2Q58EX2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDK2Q58EX2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK2Q58EX2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDK2Q58EX2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDK2Q58EX2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDK2Q58EX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms