Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC93Q567U6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC93Q567U6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC93Q567U6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC93Q567U6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CCDC93Q567U6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC93Q567U6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC93Q567U6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCDC93Q567U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCDC93Q567U6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC93Q567U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC93Q567U6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC93Q567U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC93Q567U6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC93Q567U6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC93Q567U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC93Q567U6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC93Q567U6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC93Q567U6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC93Q567U6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC93Q567U6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC93Q567U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC93Q567U6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC93Q567U6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC93Q567U6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC93Q567U6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC93Q567U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC93Q567U6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC93Q567U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC93Q567U6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC93Q567U6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC93Q567U6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC93Q567U6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC93Q567U6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms