Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1BQ53T94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1BQ53T94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1BQ53T94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1BQ53T94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAF1BQ53T94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1BQ53T94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1BQ53T94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1BQ53T94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TAF1BQ53T94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1BQ53T94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1BQ53T94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF1BQ53T94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TAF1BQ53T94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms