Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DUSP28Q4G0W2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DUSP28Q4G0W2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DUSP28Q4G0W2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUSP28Q4G0W2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DUSP28Q4G0W2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
DUSP28Q4G0W2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DUSP28Q4G0W2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DUSP28Q4G0W2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DUSP28Q4G0W2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DUSP28Q4G0W2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
DUSP28Q4G0W2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DUSP28Q4G0W2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DUSP28Q4G0W2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DUSP28Q4G0W2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
DUSP28Q4G0W2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DUSP28Q4G0W2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DUSP28Q4G0W2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DUSP28Q4G0W2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DUSP28Q4G0W2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DUSP28Q4G0W2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
DUSP28Q4G0W2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DUSP28Q4G0W2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DUSP28Q4G0W2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms