Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPEL1Q2QD12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPEL1Q2QD12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPEL1Q2QD12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEL1Q2QD12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPEL1Q2QD12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPEL1Q2QD12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPEL1Q2QD12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPEL1Q2QD12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms