Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT24Q2M2I5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KRT24Q2M2I5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KRT24Q2M2I5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KRT24Q2M2I5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KRT24Q2M2I5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KRT24Q2M2I5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KRT24Q2M2I5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KRT24Q2M2I5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
KRT24Q2M2I5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
KRT24Q2M2I5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KRT24Q2M2I5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KRT24Q2M2I5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KRT24Q2M2I5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KRT24Q2M2I5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KRT24Q2M2I5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KRT24Q2M2I5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KRT24Q2M2I5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms