Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CSPP1Q1MSJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSPP1Q1MSJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSPP1Q1MSJ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSPP1Q1MSJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CSPP1Q1MSJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSPP1Q1MSJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSPP1Q1MSJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSPP1Q1MSJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CSPP1Q1MSJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSPP1Q1MSJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CSPP1Q1MSJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms