Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA3Q16281 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNGA3Q16281 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGA3Q16281 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNGA3Q16281 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNGA3Q16281 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNGA3Q16281 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGA3Q16281 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNGA3Q16281 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNGA3Q16281 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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