Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
VPS72Q15906 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
VPS72Q15906 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
VPS72Q15906 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
VPS72Q15906 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
VPS72Q15906 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
VPS72Q15906 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS72Q15906 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS72Q15906 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS72Q15906 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS72Q15906 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VPS72Q15906 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
VPS72Q15906 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS72Q15906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VPS72Q15906 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS72Q15906 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
VPS72Q15906 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
VPS72Q15906 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
VPS72Q15906 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS72Q15906 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
VPS72Q15906 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS72Q15906 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
VPS72Q15906 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
VPS72Q15906 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS72Q15906 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
VPS72Q15906 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
VPS72Q15906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
VPS72Q15906 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS72Q15906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
VPS72Q15906 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
VPS72Q15906 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
VPS72Q15906 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
VPS72Q15906 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
VPS72Q15906 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
VPS72Q15906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
VPS72Q15906 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms