Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TLR1Q15399 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR1Q15399 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR1Q15399 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR1Q15399 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TLR1Q15399 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TLR1Q15399 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TLR1Q15399 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TLR1Q15399 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TLR1Q15399 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TLR1Q15399 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TLR1Q15399 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TLR1Q15399 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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