Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ERBB4Q15303 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ERBB4Q15303 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ERBB4Q15303 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
ERBB4Q15303 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ERBB4Q15303 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERBB4Q15303 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ERBB4Q15303 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ERBB4Q15303 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ERBB4Q15303 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB4Q15303 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERBB4Q15303 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ERBB4Q15303 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERBB4Q15303 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ERBB4Q15303 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERBB4Q15303 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ERBB4Q15303 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ERBB4Q15303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERBB4Q15303 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ERBB4Q15303 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ERBB4Q15303 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERBB4Q15303 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ERBB4Q15303 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ERBB4Q15303 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB4Q15303 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERBB4Q15303 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERBB4Q15303 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ERBB4Q15303 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERBB4Q15303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
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