Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NR1D2Q14995 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR1D2Q14995 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NR1D2Q14995 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1D2Q14995 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1D2Q14995 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1D2Q14995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1D2Q14995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1D2Q14995 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NR1D2Q14995 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR1D2Q14995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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