Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL19A1Q14993 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL19A1Q14993 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL19A1Q14993 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL19A1Q14993 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL19A1Q14993 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL19A1Q14993 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL19A1Q14993 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL19A1Q14993 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
COL19A1Q14993 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
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COL19A1Q14993 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COL19A1Q14993 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COL19A1Q14993 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL19A1Q14993 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL19A1Q14993 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL19A1Q14993 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL19A1Q14993 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL19A1Q14993 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL19A1Q14993 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL19A1Q14993 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
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