Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSPNQ14714 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSPNQ14714 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSPNQ14714 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSPNQ14714 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSPNQ14714 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SSPNQ14714 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSPNQ14714 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSPNQ14714 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SSPNQ14714 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSPNQ14714 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSPNQ14714 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SSPNQ14714 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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