Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNX2Q13950 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUNX2Q13950 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNX2Q13950 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNX2Q13950 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNX2Q13950 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNX2Q13950 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNX2Q13950 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNX2Q13950 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNX2Q13950 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNX2Q13950 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNX2Q13950 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNX2Q13950 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNX2Q13950 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
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