Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CACNA1SQ13698 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CACNA1SQ13698 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CACNA1SQ13698 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CACNA1SQ13698 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CACNA1SQ13698 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CACNA1SQ13698 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CACNA1SQ13698 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CACNA1SQ13698 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CACNA1SQ13698 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CACNA1SQ13698 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CACNA1SQ13698 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CACNA1SQ13698 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CACNA1SQ13698 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CACNA1SQ13698 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CACNA1SQ13698 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CACNA1SQ13698 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CACNA1SQ13698 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CACNA1SQ13698 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CACNA1SQ13698 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CACNA1SQ13698 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CACNA1SQ13698 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CACNA1SQ13698 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CACNA1SQ13698 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CACNA1SQ13698 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CACNA1SQ13698 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CACNA1SQ13698 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CACNA1SQ13698 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CACNA1SQ13698 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CACNA1SQ13698 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CACNA1SQ13698 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CACNA1SQ13698 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CACNA1SQ13698 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CACNA1SQ13698 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CACNA1SQ13698 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
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