Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HTR4Q13639 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HTR4Q13639 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HTR4Q13639 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTR4Q13639 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HTR4Q13639 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HTR4Q13639 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HTR4Q13639 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HTR4Q13639 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTR4Q13639 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HTR4Q13639 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HTR4Q13639 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HTR4Q13639 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HTR4Q13639 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HTR4Q13639 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HTR4Q13639 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HTR4Q13639 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HTR4Q13639 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HTR4Q13639 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HTR4Q13639 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HTR4Q13639 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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