Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SQSTM1Q13501 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SQSTM1Q13501 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SQSTM1Q13501 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SQSTM1Q13501 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SQSTM1Q13501 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SQSTM1Q13501 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SQSTM1Q13501 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SQSTM1Q13501 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SQSTM1Q13501 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQSTM1Q13501 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQSTM1Q13501 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SQSTM1Q13501 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SQSTM1Q13501 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SQSTM1Q13501 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SQSTM1Q13501 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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