Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XRCC4Q13426 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XRCC4Q13426 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
XRCC4Q13426 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XRCC4Q13426 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XRCC4Q13426 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC4Q13426 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XRCC4Q13426 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC4Q13426 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC4Q13426 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC4Q13426 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XRCC4Q13426 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XRCC4Q13426 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC4Q13426 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC4Q13426 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC4Q13426 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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