Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLN3Q13286 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLN3Q13286 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLN3Q13286 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLN3Q13286 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLN3Q13286 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLN3Q13286 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLN3Q13286 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLN3Q13286 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLN3Q13286 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLN3Q13286 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLN3Q13286 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLN3Q13286 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLN3Q13286 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLN3Q13286 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLN3Q13286 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLN3Q13286 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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