Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPS1Q13098 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPS1Q13098 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPS1Q13098 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPS1Q13098 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPS1Q13098 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPS1Q13098 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPS1Q13098 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPS1Q13098 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPS1Q13098 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPS1Q13098 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPS1Q13098 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPS1Q13098 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPS1Q13098 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GPS1Q13098 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPS1Q13098 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPS1Q13098 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
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