Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAF1Q13077 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TRAF1Q13077 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRAF1Q13077 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAF1Q13077 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRAF1Q13077 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRAF1Q13077 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAF1Q13077 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAF1Q13077 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAF1Q13077 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAF1Q13077 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAF1Q13077 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAF1Q13077 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAF1Q13077 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms