Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFX1Q12986 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFX1Q12986 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFX1Q12986 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFX1Q12986 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NFX1Q12986 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFX1Q12986 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFX1Q12986 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFX1Q12986 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFX1Q12986 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NFX1Q12986 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFX1Q12986 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFX1Q12986 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFX1Q12986 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFX1Q12986 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFX1Q12986 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFX1Q12986 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFX1Q12986 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFX1Q12986 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFX1Q12986 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFX1Q12986 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFX1Q12986 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFX1Q12986 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFX1Q12986 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFX1Q12986 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFX1Q12986 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NFX1Q12986 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
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