Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SFSWAPQ12872 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SFSWAPQ12872 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SFSWAPQ12872 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFSWAPQ12872 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFSWAPQ12872 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFSWAPQ12872 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFSWAPQ12872 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFSWAPQ12872 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFSWAPQ12872 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFSWAPQ12872 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFSWAPQ12872 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms