Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPTFQ12830 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BPTFQ12830 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BPTFQ12830 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BPTFQ12830 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BPTFQ12830 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BPTFQ12830 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BPTFQ12830 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BPTFQ12830 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BPTFQ12830 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BPTFQ12830 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BPTFQ12830 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BPTFQ12830 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BPTFQ12830 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BPTFQ12830 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BPTFQ12830 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BPTFQ12830 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BPTFQ12830 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPTFQ12830 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BPTFQ12830 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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