Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FAAP100Q0VG06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FAAP100Q0VG06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FAAP100Q0VG06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FAAP100Q0VG06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FAAP100Q0VG06 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
FAAP100Q0VG06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FAAP100Q0VG06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
FAAP100Q0VG06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FAAP100Q0VG06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FAAP100Q0VG06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FAAP100Q0VG06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FAAP100Q0VG06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FAAP100Q0VG06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FAAP100Q0VG06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FAAP100Q0VG06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAAP100Q0VG06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FAAP100Q0VG06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FAAP100Q0VG06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FAAP100Q0VG06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FAAP100Q0VG06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FAAP100Q0VG06 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FAAP100Q0VG06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FAAP100Q0VG06 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FAAP100Q0VG06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FAAP100Q0VG06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FAAP100Q0VG06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FAAP100Q0VG06 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAAP100Q0VG06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FAAP100Q0VG06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms