Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCNQ0VAF6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCNQ0VAF6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYCNQ0VAF6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCNQ0VAF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYCNQ0VAF6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYCNQ0VAF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYCNQ0VAF6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms