Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-211ENST00000526023 477 ntTSL 516.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 313.23□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-206ENST00000469089 707 ntTSL 313.07□□□□□ -0.323e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 55.36□□□□□ -1.553e-9■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 312.45□□□□□ -0.422e-53■■■■■ 33.4
SRSF1Q07955 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 ATRX-209ENST00000623242 725 ntTSL 34.02□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)2.97□□□□□ -1.932e-7■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 211.84□□□□□ -0.515e-27■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 HERPUD1-210ENST00000565966 798 ntTSL 512.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 HERPUD1-218ENST00000569569 1125 ntTSL 212.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 33.3
SRSF1Q07955 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 29.65□□□□□ -0.863e-14■■■■■ 33.1
SRSF1Q07955 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 33
SRSF1Q07955 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.852e-9■■■■■ 33
SRSF1Q07955 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 512.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-210ENST00000586714 594 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.082e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-215ENST00000588897 2283 ntTSL 28.14□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-217ENST00000590078 2392 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.212e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-208ENST00000464398 540 ntTSL 37.31□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 37.31□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 26.66□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 55.91□□□□□ -1.462e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 SMYD3-213ENST00000488153 653 ntTSL 35.52□□□□□ -1.532e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-10■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-10■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 32.8
SRSF1Q07955 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 525.81■■□□□ 1.727e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 RALY-207ENST00000481580 773 ntTSL 222.59■■□□□ 1.217e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 17e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 317.55■□□□□ 0.47e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 513.06□□□□□ -0.327e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 32.6
SRSF1Q07955 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 218.99■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-10■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 25.67□□□□□ -1.56e-12■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.666e-12■■■■■ 32.5
SRSF1Q07955 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 32.2
SRSF1Q07955 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-19■■■■■ 32.2
SRSF1Q07955 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-19■■■■■ 32.2
SRSF1Q07955 THOP1-203ENST00000585338 761 ntTSL 324.04■■□□□ 1.442e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 323.4■■□□□ 1.342e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 THOP1-206ENST00000586780 421 ntTSL 317.26■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 411.65□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.482e-10■■■■■ 32
SRSF1Q07955 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 24.73□□□□□ -1.652e-10■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.175e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-204ENST00000421164 1706 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.045e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.05■□□□□ 05e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-211ENST00000436447 3003 ntTSL 514.13□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-215ENST00000457926 2919 ntTSL 214.13□□□□□ -0.155e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-206ENST00000423684 595 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-205ENST00000421780 526 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-202ENST00000388970 1466 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-212ENST00000437774 3134 ntTSL 210.23□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 AFG3L1P-216ENST00000458301 2298 ntTSL 29.28□□□□□ -0.925e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 38.63□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 31.9
SRSF1Q07955 ASNS-208ENST00000442734 828 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 31.8
SRSF1Q07955 RRM2-206ENST00000474701 1060 ntTSL 213.21□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 PFAS-204ENST00000580251 559 ntTSL 317.83■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 PFAS-203ENST00000578979 765 ntTSL 216.29■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 PFAS-202ENST00000546020 2652 ntTSL 212.57□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 210.09□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 CCDC136-203ENST00000459946 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.59■■□□□ 1.218e-8■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 CCDC136-211ENST00000485998 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.66■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 31.7
SRSF1Q07955 MTMR14-209ENST00000437997 718 ntTSL 323.43■■□□□ 1.346e-10■■■■■ 31.6
SRSF1Q07955 MTMR14-212ENST00000480578 387 ntTSL 213.74□□□□□ -0.216e-10■■■■■ 31.6
SRSF1Q07955 LONP1-207ENST00000588589 684 ntTSL 213.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.322e-9■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 518.69■□□□□ 0.584e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 518.65■□□□□ 0.584e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 418.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 31.5
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 50 ms