Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFF3Q07654 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFF3Q07654 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFF3Q07654 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF3Q07654 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFF3Q07654 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TFF3Q07654 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFF3Q07654 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TFF3Q07654 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFF3Q07654 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF3Q07654 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFF3Q07654 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFF3Q07654 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFF3Q07654 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFF3Q07654 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms