Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX1T1Q06455 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNX1T1Q06455 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX1T1Q06455 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUNX1T1Q06455 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNX1T1Q06455 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUNX1T1Q06455 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RUNX1T1Q06455 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNX1T1Q06455 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNX1T1Q06455 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX1T1Q06455 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNX1T1Q06455 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms