Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
REG3AQ06141 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
REG3AQ06141 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
REG3AQ06141 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
REG3AQ06141 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
REG3AQ06141 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REG3AQ06141 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REG3AQ06141 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms