Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
ERCC6Q03468 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
ERCC6Q03468 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC50.32■■■■■ 5.65
ERCC6Q03468 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
ERCC6Q03468 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
ERCC6Q03468 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.23■■■■■ 5.63
ERCC6Q03468 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
ERCC6Q03468 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.2■■■■■ 5.63
ERCC6Q03468 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.19■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC50.16■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC50.13■■■■■ 5.62
ERCC6Q03468 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.11■■■■■ 5.61
ERCC6Q03468 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
ERCC6Q03468 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
ERCC6Q03468 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
ERCC6Q03468 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC50.02■■■■■ 5.6
ERCC6Q03468 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
ERCC6Q03468 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
ERCC6Q03468 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
ERCC6Q03468 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ERCC6Q03468 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
ERCC6Q03468 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC49.88■■■■■ 5.58
ERCC6Q03468 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.57
ERCC6Q03468 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
ERCC6Q03468 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
ERCC6Q03468 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
ERCC6Q03468 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.75■■■■■ 5.55
ERCC6Q03468 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
ERCC6Q03468 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
ERCC6Q03468 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.54
ERCC6Q03468 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
ERCC6Q03468 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
ERCC6Q03468 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
ERCC6Q03468 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC49.63■■■■■ 5.53
ERCC6Q03468 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
ERCC6Q03468 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.61■■■■■ 5.53
ERCC6Q03468 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC49.59■■■■■ 5.53
ERCC6Q03468 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.57■■■■■ 5.53
ERCC6Q03468 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
ERCC6Q03468 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
ERCC6Q03468 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC49.55■■■■■ 5.52
ERCC6Q03468 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC49.54■■■■■ 5.52
ERCC6Q03468 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.47■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
ERCC6Q03468 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
ERCC6Q03468 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
ERCC6Q03468 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
ERCC6Q03468 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
ERCC6Q03468 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC49.37■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
ERCC6Q03468 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
ERCC6Q03468 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
ERCC6Q03468 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
ERCC6Q03468 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
ERCC6Q03468 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
ERCC6Q03468 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
ERCC6Q03468 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
ERCC6Q03468 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
ERCC6Q03468 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
ERCC6Q03468 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.46
ERCC6Q03468 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ERCC6Q03468 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ERCC6Q03468 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
ERCC6Q03468 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
ERCC6Q03468 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.12■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
ERCC6Q03468 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
ERCC6Q03468 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC49.01■■■■■ 5.44
ERCC6Q03468 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
ERCC6Q03468 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.98■■■■■ 5.43
ERCC6Q03468 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC48.97■■■■■ 5.43
ERCC6Q03468 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
ERCC6Q03468 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
ERCC6Q03468 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.42
ERCC6Q03468 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
ERCC6Q03468 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms