Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms