Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKPQ01813 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PFKPQ01813 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKPQ01813 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKPQ01813 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PFKPQ01813 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PFKPQ01813 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PFKPQ01813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PFKPQ01813 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PFKPQ01813 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PFKPQ01813 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PFKPQ01813 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PFKPQ01813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms