Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MC1RQ01726 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MC1RQ01726 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MC1RQ01726 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MC1RQ01726 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MC1RQ01726 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MC1RQ01726 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MC1RQ01726 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MC1RQ01726 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MC1RQ01726 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MC1RQ01726 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MC1RQ01726 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MC1RQ01726 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms