Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRCDQ00LT1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRCDQ00LT1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRCDQ00LT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRCDQ00LT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRCDQ00LT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRCDQ00LT1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRCDQ00LT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRCDQ00LT1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms