Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HDLBPQ00341 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.77■■■■□ 3
HDLBPQ00341 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HDLBPQ00341 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HDLBPQ00341 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HDLBPQ00341 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HDLBPQ00341 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HDLBPQ00341 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HDLBPQ00341 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HDLBPQ00341 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HDLBPQ00341 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HDLBPQ00341 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDLBPQ00341 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDLBPQ00341 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
HDLBPQ00341 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDLBPQ00341 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HDLBPQ00341 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HDLBPQ00341 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDLBPQ00341 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDLBPQ00341 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDLBPQ00341 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
HDLBPQ00341 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HDLBPQ00341 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HDLBPQ00341 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms